- Информация о материале
- Просмотров: 4376
Tkachik T.E., Tolkova E.S.
Email: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.
Tkachik Timofey Eduardovich - PhD in Biology, Head;
Tolkova Ekaterina Sergeevna – Specialist,
CENTRE OF GENOMICS AND MOLECULAR BIOLOGY,
LLC RTC “CHERKIZOVO”,
MOSCOW
Abstract: the aim of this study was to evaluate genetic variability of ORF7 of recent PRRSV isolates obtained from various farms in Russian Federation by performing phylogenetic analysis of sequences. Overall, 32 full sequences of ORF7 were obtained. Alignment was performed for nucleotide sequences and amino acid sequences. For nucleotide sequence alignment phylogenetic tree was constructed. Phylogenetic analysis showed that type 1 PRRSV isolates belonged to subtype 1. Type 2 PRRSV isolates most closely resembled Ingelvac® PRRS MLV vaccine strain which corresponds with previously published data. Amino acid sequence alignment showed only single amino acid substitutions.
Keywords: PRRS, ORF7, capillary electrophoresis, phylogenetic analysis.
Ткачик Т.Э., Толькова Е.С.
Ткачик Тимофей Эдуардович - кандидат биологических наук, руководитель;
Толькова Екатерина Сергеевна - специалист,
Центр геномики и молекулярной биологии,
ООО Научно-испытательный центр «ЧЕРКИЗОВО»,
г. Москва
Аннотация: целью данного исследования было оценить вариабельность гена ORF7 изолятов вируса РРСС, выделенных со свиноферм в различных регионах Российской Федерации. Было получено в общей сложности 32 полных сиквенса ORF7. Проведено выравнивание нуклеотидных последовательностей с последующим построением дендрограмм и выравнивание аминокислотных последовательностей. Филогенетический анализ показал, что изоляты вируса РРСС 1-го типа относились к 1 подтипу. Изоляты вируса РРСС 2-го типа генетически были наиболее близки к штамму вакцины Ingelvac® PRRS MLV, что согласуется с ранее опубликованными данными. Выравнивание аминокислотных последовательностей показало, что рассмотренные изоляты характеризуются только одиночными заменами аминокислот.
Ключевые слова: РРСС, ORF7, секвенирование, филогенетический анализ.
Список литературы / References
- Balka G., Hornyak A., Balint A., Kiss I., Kecskemeti S., Bakonyi T., Rusvai M. Genetic diversity of porcine reproductive and respiratory syndrome virus strains circulating in Hungarian swine herds. Vet. Microbiol, 2008. 127, 128–135.
- Dewey C., Charbonneau G., Carman S., Hamel A., Nayar G., Friendship R., Eernisse K., Swenson S. Lelystad-like strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) identified in Canadian swine. Can. Vet. J., 2000. 41, 493–494.
- Faaberg K.S., Balasuriya U.B., Brinton M.A., Gorbalenya A.E., Leung F.C-C., Nauwynck H., Snijder E.J., Stadejek T., Yang H., Yoo D. Arteriviridae. In: Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, King, A.M.Q., Adams, M.J., Carstens, E.B., Lefkowitz, E.J. Elsevier Academic Press, 2012, San Diego, USA, 796–805.
- Kapur V., Elam M.R., Pawlovich T.M., Murtaugh M.P. Genetic variation in porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolates in the midwestern United States. J. Gen. Virol., 1996. 77 (Pt 6), 1271–1276.
- Keffaber K.K. Reproductive failure of unknown etiology. Am. Assoc. Swine Pract. Newsl., 1989. 1, 1-10.
- Kvisgaard L.K., Hjulsager C.K., Brar M.S., Leung F.C.C., Larsen L.E. Genetic dissection of complete genomes of Type 2 PRRS viruses isolated in Denmark over a period of 15 years. Vet. Microbiol., 2013. 167, 334–344.
- Lee C., Kim H., Kang B., Yeom M., Han S., Moon H., Park S., Kim H., Song D., Park B. Prevalence and phylogenetic analysis of the isolated type I porcine reproductive and respiratory syndrome virus from 2007 to 2008 in Korea. Virus Genes, 2010. 40, 225–230.
- Meulenberg J.J., Hulst M.M., de Meijer E.J., Moonen P.L., den Besten A., de Kluyver E.P., Wensvoort G., Moormann R.J. Lelystad virus, the causative agent of porcine epidemic abortion and respiratory syndrome (PEARS), is related to LDV and EAV. Virology, 1993. 192, 62–72.
- Nieuwenhuis N., Duinhof T.F., van Nes A. Economic analysis of outbreaks of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in nine sow herds. Vet Rec, 2012. 170:225.
- OIE – Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals (2017). Chapter 2.8.6. Porcine reproductive and respiratory syndrome. [Электронный ресурс]. Режим доступа: http://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/2.08.06_PRRS.pdf/ (дата обращения: 25.06.2018).
- Rosendal T., Dewey C., Friendship C., Wootton S., Young B., Poljak Z. Association between the genetic similarity of the open reading frame 5 sequence of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus and the similarity in clinical signs of Porcine reproductive and respiratory syndrome in Ontario swine herds. The Canadian Journal of Veterinary Research, 2014. 78, 250–259.
- Shi M., Lam T.T., Hon C.C., Hui R.K., Faaberg K.S., Wennblom T., Murtaugh M.P., Stadejek T., Leung F.C. Molecular epidemiology of PRRSV: a phylogenetic perspective. Virus Res, 2010. 154, 7-17.
- Stadejek T., Oleksiewicz M.B., Scherbakov A.V., Timina A.M., Krabbe J.S., Chabros K., Potapchuk D. Definition of subtypes in the European genotype of porcine reproductive and respiratory syndrome virus: nucleocapsid characteristics and geographical distribution in Europe. Archives of Virology, 2008. 153, 1479–1488.
- Stadejek T., Stankeviciu, A., Murtaugh M.P., Oleksiewicz M.B. Molecular evolution of PRRSV in Europe: Current state of play. Vet. Microbiol, 2013. 165, 21–28.
- Thanawongnuwech R., Amonsin A., Tatsanakit A., Damrongwatanapokin S. Genetics and geographical variation of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) in Thailand. Vet. Microbiol, 2004. 101, 9–21.
- Wang P.P., Dong J.G., Zhang L.Y., Liang P.S., Liu Y.L., Wang L., Fan F.H., Song C.X. Sequence and Phylogenetic Analyses of the Nsp2 and ORF5 Genes of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus in Boars from South China in 2015. Transboundary and Emerging Diseases, 2017. 64. 1953–1964.
- Wensvoort G., Terpstra C., Pol J.M., ter Laak E.A. Bloemraad M., de Kluyver E.P., Kragten C., van Buiten L., den Besten A., Wagenaar F. Mystery swine disease in The Netherlands: the isolation of Lelystad virus. Vet. Q., 1991. 13, 121-130.
Ссылка для цитирования данной статьи
![]() |
Тип лицензии на данную статью – CC BY 4.0. Это значит, что Вы можете свободно цитировать данную статью на любом носителе и в любом формате при указании авторства. | |
Ссылка для цитирования. Ткачик Т.Э., Толькова Е.С. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА РЕПРОДУКТИВНО-РЕСПИРАТОРНОГО СИНДРОМА СВИНЕЙ ПО ГЕНУ ORF7 [PHYLOGENETIC ANALYSIS OF ORF7 SEQUENCES FROM PORCINE REPRODUCTIVE AND RESPIRATORY SYNDROME VIRUS ISOLATES] // International Scientific Review of the Problems and Prospects of Modern Science and Education: XLVII International Scientific and Practical Conference ( Boston, USA - 26 July, 2018). с. {см. сборник} |
- Информация о материале
- Просмотров: 5002
Конференция проводится один раза месяц.
Мы работаем максимально быстро. Рецензирование до 24 часов. Отправка Справки о публикации статьи до 48 часов, выписка официального Диплома до 48 часов, публикация статей на сайте
Свободное копирование с ссылкой на журнал: http://scientific-conference.com/ до 48 часов в рабочие дни. Статья размещается на сайте журнала вне pdf-версии журнала только при заказе Диплома печатного или электронного. Вы можете ознакомиться с алгоритмом работы издательства здесь >>>.
Мы рецензируем, редактируем, корректируем Ваши работы. Если редакция получит статью в последний день, есть большая вероятность того, что мы не успеем обработать Вашу статью. Убедительная просьба, если Вы хотите опубли-коваться в ближайшем номере, не откладывайте отправку заявки. Потратьте одну минуту, заполните и отправьте заявку в Редакцию.
Архив до 2015 года
До VIII конференции, все номера дублированы на сайте издательства "Проблемы науки". Начиная с VIII конференции, архивы журнала размещаются только на данном сайте.
График выхода на 2015 год
График выхода на 2016 год
График выхода на 2017 год (в сентябре не проводится)
Если дата проведения конференции назначена на выходной или праздничный день, то дата проведения конференции переносится на первый, после выходных, рабочий день.
- Информация о материале
- Просмотров: 4335
Нажмите кнопку «ПОЛУЧИТЬ»
После этого Вы скачаете заявку, правила оформления и образец оформления
Для того, что приступить к публикации научной статьи
1. Разархивируйте архив.
2. Заполните заявку.
3. Оформите статью в соответствии с правилами оформления.
4. Пришлите в заявку и статью Редакцию.
Если Вы не знаете, куда скачиваются файлы из интернета, как распаковывать архив и т. д.
Напишите в Редакцию. Вам вышлют заявку, правила оформления и образец оформления и помогут с оформлением.
+7(915)814-09-51; +7(961)245-79-19 (Билайн)
Email:
Время работы:
Пн.-Пт.: 10-00 до 17-00
Сб.-Вс.: 10-00 до 15-00
Если есть вопросы, Вы всегда можете задать их сотрудникам Отдела поддержки авторов.
- Информация о материале
- Просмотров: 5052
Вальцев Сергей Витальевич (Россия) - главный редактор, канд. псих. наук. Email: Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.;
![]() |
![]() |
Абдуллаев Камран Нуреддин оглы (Азербайджанская Республика)
Институт Экономики. Национальная Академия Наук Азербайджана. Отдел «Проблемы развития сферы услуг». Ph.d in economics. Ведущий научный сотрудник. |
||
![]() |
![]() |
Акбулаев Нурходжа Назирходжаевич (Азербайджанская Республика)
Азербайджанский государственный экономический университет. Кафедра экономики и менеджмента. Доктор экономических наук. |
||
![]() |
![]() |
Ананьева Елена Павловна (Россия)
Южноукраинский национальный педагогический университет им. К.Д. Ушинского. Кафедра философии и социологии. Доцент. Доктор философских наук. |
||
![]() |
![]() |
Блейх Надежда Оскаровна (Россия)
Северо-Осетинский государственный университет им. К.Л.Хетагурова (г. Владикавказ). Факультет социальной работы. Кафедра психолого-педагогических и медицинских проблем социальной работы. Кандидат педагогических наук. Доктор исторических наук. Профессор. |
||
![]() |
![]() |
Бородай Владимир Александрович (Россия)
Донской государственный технический университет (ДГТУ). Факультет «Право, сервис и туризм», кафедра «Сервис, туризм и индустрия гостеприимства». Должность Профессор. Доцент. Доктор социологических наук. |
||
![]() |
![]() |
Гарагонич Василий Васильевич (Украина)
Восточноевропейский славянский университет. Кафедра международных отношений. Заведующий кафедрой. Профессор. Доктор исторических наук. Почетное звание «Заслуженный работник образования». Ужгородский национальный университет. Кафедра туристической инфраструктуры и сервиса факультета туризма и международных коммуникаций. Профессор. |
||
![]() |
![]() |
Глущенко Александр Григорьевич (Россия)
Поволжский государственный университет телекоммуникаций и информатики. Кафедра физики. Заведующий кафедрой. Доктор физико-математических наук. Профессор. Член Российской Академии Естествознания, член Европейской Академии Естествознания, член Академии Телекоммуникаций. |
||
![]() |
![]() |
Доленко Георгий Николаевич (Россия)
Сибирский университет потребительской кооперации. Кафедра технологии. Профессор. Доктор химических наук. Член Российской экологической академии. |
||
![]() |
![]() |
Жолдошев Сапарбай Тезекбаевич (Кыргызская Республика)
Ошский государственный университет. Медицинский факультет. Доцент. Доктор медицинских наук. Член-корреспондент Российской Академии Естествознания. |
||
![]() |
![]() |
Ильинских Николай Николаевич (Россия)
ГБОУ ВПО «Сибирский государственный медицинский университет» Минздрава РФ. Кафедра биологии и генетики. Заведующий кафедрой. Профессор. Доктор биологических наук. Член-корреспондент Международной Академии Наук Высшей Школы РФ. Член “New York Academy of Sciences” (Serving Science, Technology, and So-ciety Worldwide Since) An Active Member of this Academy. Член Международного Радиологического обществ. Заслуженный деятель науки. Заслуженный работник высшей школы. Руководитель Федеральной целевой программы № П1294. |
||
![]() |
![]() |
Кафтаева Маргарита Владиславна (Россия)
Белгородский государственный технологический университет им. В.Г. Шухова. Кафедра городского кадастра и инженерных изысканий. Доцент. Доктор технических наук. Профессор Российской Академии Естествознания. |
||
![]() |
![]() |
Кузьмин Сергей Борисович (Россия)
Институт географии им. В.Б. Сочавы Сибирское отделение Российской академии наук. Лаборатория геоморфологии. Ведущий научный сотрудник. Доктор географических наук. Член Русского географического общества. |
||
![]() |
![]() |
Куликова Элла Германовна (Россия)
Ростовский государственный экономический университет (РИНХ). Кафедра русского языка и культуры речи. Заведующий кафедрой. Профессор. Доктор филологических наук. Член Ассоциации преподавателей древних языков. |
||
![]() |
![]() |
Курманбаева Меруерт Сакеновна (Казахстан)
Казахский Национальный Университет им. аль-Фараби. Кафедра биоразнообразия и биоресурсов. Заведующий кафедрой. И.о. Профессора. Доктор биологических наук. |
||
![]() |
![]() |
Курпаяниди Константин Иванович (Узбекистан)
Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Ферганский политехнический институт». Кафедра «Экономика». Доцент. Doctor of Philosophy (PhD) in economics. Профессор Российской Академии Естествознания. |
||
![]() |
![]() |
Лукиенко Леонид Викторович (Россия)
ФГБОУ ВО Тульский педагогический университет им. Л.Н. Толстого. Кафедра «Агроинженерии и техносферной безопасности. Заведующий кафедрой. Доктор технических наук. |
||
![]() |
![]() |
Linkova-Daniels Natalia (Australia)
Ural State University of Railway Transport (USURT) Ekaterinburg. PhD in Pedagogic Sc., Associate Professor. Register Nurse, Tempsmart Agency (Brisbane), Australia. |
||
![]() |
![]() |
Макаров Аркадий Николаевич (Россия)
Кировская государственная медицинская академия. Кафедра иностранных языков. Доцент. Доктор филологических наук. |
||
![]() |
![]() |
Мейманов Бактыбек Каттоевич (Кыргызская Республика)
Кыргызский экономический университет им.М.Рыскулбекова (КЭУ). Институт непрерывного открытого образования. И.о. профессора. Доктор экономических наук. |
||
![]() |
![]() |
Наумов Владимир Аркадьевич (Россия)
Калининградский государственный технический университет. Кафедра водных ресурсов и водопользования. Заведующий кафедрой. Доктор технических наук. Член Российской инженерной академия. Член Российской академии естественных наук. |
||
![]() |
![]() |
Петров Владислав Олегович (Россия)
Астраханская государственная консерватория. Кафедра теории и истории музыки. Доцент. Доктор искусствоведения. Заслуженный работник науки и образования, член-корреспондент РАЕ. Руководитель Астраханского филиала Межрегиональной российской общественной организации «Гильдия музыковедов». |
||
![]() |
![]() |
Рахимбеков Сармантай Мадивич (Казахстан)
Казахский технический университет им.К.И.Сатпаева. Кафедра маркшейдерского дела и геодезии. Доктор технический наук. Профессор. Действительный член Международной академии информатизации, действительный член Национальной академии горных наук. |
||
![]() |
![]() |
Розыходжаева Гульнора Ахмедовна (Узбекистан)
Центральная Клиническая Больница №1 Медико-Санитарного Объединения при Министерстве Здравоохранения Республики Узбекистан. Клинико-диагностический отдел. Руководитель отдела. Доктор медицинских наук. |
||
![]() |
![]() |
Романенкова Юлия Викторовна (Украина)
Киевский университет имени Бориса Гринченко. Институт искусств. Кафедра изобразительного искусства. Заведующей кафедрой. Профессор. Доктор искусствоведения. Действительный член (академик) Академии критики, искусства и эстетических наук (Киев, Украина) |
||
![]() |
![]() |
Самков Алексей Викторович (Россия)
Смоленский филиал Российского экономического университета. Кафедра менеджмента и таможенного дела. Профессор. Доктор технических наук. Академик транспортной академии (Украина, Киев). |
||
![]() |
![]() |
Селитреникова Татьяна Анатольевна (Россия)
Тамбовский государственный университет имени Г.Р. Державина. Институт физической культуры и спорта. Кафедра «Адаптивной физической культуры и основ безопасности жизнедеятельност». Доцент кафедры. Доктор педагогических наук. |
||
![]() |
![]() |
Скрипко Татьяна Александровна (Украина)
Львовский торгово-экономический университет. Кафедра менеджмента. Професор кафедры. Доктор экономических наук. |
||
![]() |
![]() |
Сопов Александр Валентинович (Россия)
Майкопский государственный технологический университет. Кафедра истории государства и права. Профессор. Доктор исторических наук. Академик (действительный член) Российской Академии Естествознания, председатель правления республиканского регионального отделения Ассоциации антропологов и этнологов России, Почётный работник высшего профессионального образования Российской Федерации. Член Европейской академии естествознания (EANH). Член международной академии естествознания (IANH). Член научной консультативной группы Европейской академии естествознания (SCG ANH). |
||
![]() |
![]() |
Стукаленко Нина Михайловна (Казахстан)
Кокшетауский государственный университет им. Ш.Уалиханова, г. Кокшетау. Кафедра педагогики, психологии и социальной работы. Профессор. Доктор педагогических наук. Член-корреспондент Российской Академии Естествознания, действительный член ЕАЕ. Обладатель Почетных званий «Заслуженный деятель науки и образования» и «Основатель научной школы». |
||
![]() |
![]() |
Трегуб Илона Владимировна (Россия)
Финансовый университет при Правительстве РФ. Департамент анализа данных, принятия решений и финансовых технологий. Профессор. Доктор экономических наук, кандидат технических наук. Член Российской Академии Естествознания. Член Вольного экономического общества. Эксперт РАН. |
||
![]() |
![]() |
Упоров Иван Владимирович (Россия)
Краснодарский университет МВД России. Кафедра конституционного и административного права. Профессор. Доктор исторический наук. Кандидат юридических наук. Член Союза журналистов России. |
||
![]() |
![]() |
Хилтухина Евгения Геннадьевна (Россия)
Российский государственный уиверситет им. А.Н.Косыгина. Кафедра философии. Профессор. Доктор философских наук. Член философского общества. Член культурологического обществ. |
||
![]() |
![]() |
Чиладзе Георгий Бидзинович (Грузия)
Национальная Ассоциация Научной Аналитики Грузии. Президент. Доктор юридических наук (LLD), доктор экономических наук (DBA), доктор инженерных наук (DES). Профессор. Заслуженный деятель науки и образования. Член-корреспондент Российской Академии Естествознания. |
Полный список членов Редколлегии на сайте издательства «Проблемы науки» >>>