Медицинские науки

Молекулярно-генетические основы сочетанного течения гнездной алопеции и аутоиммунных заболеваний щитовидной железы / Molecular genetic basis of the comorbidity of alopecia areata and autoimmune thyroid disease

Николаева Татьяна Владимировна / Nikolaeva Tat'jana – кандидат медицинских наук, доцент, кафедра дерматовенерологии, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования Оренбургский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения Российской Федерации, г. Оренбург

Аннотация: установлено, что гнездная алопеция в 11,0% случаев сочеталась с диффузным токсическим зобом, в 22,2% случаев – с аутоиммунным тиреоидитом. Биоинформационный анализ обогащения сигнальных и метаболических путей белковыми продуктами генов, ассоциированных по данным GWAS, с гнездной алопецией (HLA-DQA2, ULBP3, ULBP6, CTLA4, ICOS, IL2RA, IKZF4, IL2 - IL21, PRDX5 и STX17), был выполнен с использованием ресурса STRING (Search Tool for Retrieval of Interacting Gines/Proteins) и базы данных KEGG (Kioto Encyclopedia of Genes and Genomes). Выявлено значительное обогащение KEGG-пути hsa05320 «Аутоиммунные заболевания щитовидной железы» (значение р с корректировкой по методу FDR-контроля = 0,00022), белковым продуктами генов IL2, HLA-DQA2, CTLA4, ассоциированных с гнездной алопецией. Это является вероятным объяснением коморбидности гнездной алопеции и аутоиммунного тиреоидита и диффузного токсического зоба.

Abstract: it was recognized that alopecia areata in 11.0% of cases combined with diffuse toxic goiter and in 22.2% of cases it was combined with autoimmune thyroiditis. Pathway enrichment analysis by protein coding genes at AA GWAS loci (HLA-DQA2, ULBP3, ULBP6, CTLA4, ICOS, IL2RA, IKZF4, IL2 - IL21, PRDX5 and STX17), was performed using STRING resource (Search Tool for Retrieval of Interacting Gines / Proteins ), and the KEGG database (Kioto Encyclopedia of Genes and Genomes). There was a significant enrichment of KEGG-way hsa05320 «Autoimmune thyroid disease" (p-value adjusted by the method of FDR-Control = 0.00022), the protein products of the genes IL2, HLA-DQA2, CTLA4, associated with alopecia areata. This is a possible explanation for the comorbidity of alopecia areata and autoimmune thyroiditis and Graves' disease.

Ключевые слова: гнездная алопеция, аутоиммунные заболевания щитовидной железы, анализ обогащения путей.

Keywords: аlopecia areata, аutoimmune thyroid disease, pathway enrichment analysis.

Литература

1. Kasumagić-Halilović E.Thyroidautoimmunityinpatientswithalopeciaareata // ActaDermatovenerol. ,
2. Seyrafi H., Akhiani M., Abbasi H., Mirpour S., Gholamrezanezhad A. Evaluation of the profile of alopecia areata and the prevalence of thyroid function test abnormalities and serum autoantibodies in Iranian patients // BMC Dermatol., 2005. Vol. 31. №Р.
3. Noso S., Park C., Babaya N., Hiromine Y., Harada T., Ito H., Taketomo Y., Kanto K., Oiso N., Kawada A., Suzuki T., Kawabata Y., Ikegami H. Organ specificity in autoimmune diseases: thyroid and islet autoimmunity in alopecia areata // J. Clin. Endocrinol. Metab.,Р. 1976– 19
4. Sobolewska-Włodarczyk A., Włodarczyk M., Fichna J., Wiśniewska-Jarosińska M. Alopecia areata in patients with inflammatory boweldisease: an // FoliaMed. ,Р. 5–
5. Petukhova L., Christiano A. M. Functional Interpretation of Genome-Wide Association Study Evidence in Alopecia Areata // J. Invest. Dermatol.,Р. 314 – 317.
6. БазаданныхНациональногоинститутаисследованийгеномачеловека (The NHGRI-EBI Catalog of published genome-wide association studies) [Электронныйресурс]. Режим доступа: http: http://www.ebi.ac.uk/gwas/search?query=alopecia%20areata/ (дата обращения: 09.06.2015).
7. Petukhova L., Duvic M., Hordinsky M., Norris D., Price V., Shimomura Y., Kim H., Singh P., Lee A., Chen W. V., Meyer K. C., Paus R., Jahoda C. A., Amos C. I., Gregersen P. K., Christiano A. M. Genome-wide association study in alopecia areata implicates both innate and adaptive immunity // Nature, 2010. Vol. 466. № Р. 113 – 11
8. Benjamini Y., Hochberg Y. Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing // J. R. Stat. Soc. B., 1995. № 57. P 289 – 300.
9. Базаданных STRING (Search Tool for Retrieval of Interacting Gines/Proteins). [Электронный ресурс]. Режим доступа: http://www.string-db./ (дата обращения: 15.
10. Базаданных KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). [Электронный ресурс]. Режим доступа: http://www.kegg.jp/ (дата обращения: 15.09.16).

Поделитесь данной статьей, повысьте свой научный статус в социальных сетях